Нуклеинска киселина је затворена у неку врсту контејнера или превлаке, која се назива капсида, и састоји се од понављања протеинских подјединица, тзв. цапсомерс, заузврат настаје понављањем једног, два или више протеина. У папилома вирусу, на пример, капсид се састоји од неколико копија два различита протеина, Л1 и Л2; први, обилнији, има способност самоагрегације и формирања вириона без нуклеинских киселина (веома је имуноген и стога се користи као основа за производњу вакцина).
Тхе језгро гарантује вирусу способност извођења процеса умножавања и раста, док капсид даје облик и стабилност вирусној честици, штити њен геном и важан је за инфективност (захваљујући присуству структура против рецептора).
Заједно, капсид и нуклеинска киселина творе нуклеокапсид.
У природи постоје вируси настали само од нуклеинских киселина и капсида, па се из тог разлога називају "голи вируси"; бактериофаги су пример голих вируса. Постоје и друге вирусне честице које поред капсиде представљају и најудаљенију мембрану, која се назива перикапсид, пеплос или огртач (коверта), који потиче од плазма мембране ћелије домаћина и као такав се састоји углавном од фосфолипида, али и од полисахарида и протеина (генерално гликопротеина). Вируси са перикапсидом се зову "обложен вирусом"и генерално такође поседују протеинску структуру, звану матрикс или интегумент, која се налази између капсиде и перикапсида.
Обложени вируси - захваљујући перицапсидним фосфолипидима - лакше продиру у осетљиве ћелије и смањују имунолошки одговор домаћина; аденовирус, одговоран за симптоме коњунктивитиса и параинфлуенце, пример је обложеног вируса, као и сви други вируси вируси који инфицирају еукариоте.
Вирусни капсид нормално може попримити две различите конформације, за које је карактеристична једна структура икосаедричког типа или спирални.
Икосаедар је чврсто тело, формирано једнакостраничним троугловима, које има 12 темена, 20 лица састављених од једнакостраничних троуглова и 30 ивица које одговарају страницама троуглова, док су темена тачке спајања страница. Ова кристалографска структура потиче од синдикат регулише више протеина; сваки од њих се назива мономер и ови мономери се могу придружити пет до пет формирајућих пентона, или - код већих вируса - 6 до 6 формирајући такозване егзоне. Удружење пентона и егзона чини еикосаедар, унутар којег се налази генетски материјал.
У другој структурној типологији капсиде, која се назива спирална, појединачни мономери су распоређени у спиралу око осе (протеини су распоређени попут степеница спиралног степеништа), формирајући шупљи цилиндар који затвара нуклеинску киселину.
Вирус дуванског мозаика типичан је пример вируса спиралне структуре, док вирус папилома има икосаедарску структуру. Постоје и вируси код којих капсиди недостаје симетрија и има мешовиту морфологију (попут вируса ХИВ -а, који се састоји од икосаедричног капсида и влакнастог језгра нуклеинске киселине).
Класификација вируса
Сваки вирус је идентификован врстом, родом и породицом. На пример, ако узмемо ХИВ вирус, врста означава заједнички назив микрогранизма, то је вирус стечене имунодефицијенције или, прецизније, ХИВ.Овај вирус припада роду лентивируса (тј. Са спорим циклусом раста) и ретровиридае породица (ретровируси су вируси са репликативним циклусом који карактеришу два облика нуклеинске киселине, који представљају ензим који се назива реверзна транскриптаза, способан да изврши обрнуту транскрипцију претварајући вирусну РНК у ДНК).
Свака вирусна врста се затим описује на основу структуре (величина, морфологија и тип нуклеинске киселине), типа репликације (нуклеарне или цитоплазматске), ћелије домаћина (животиње, гљиве, биљке или бактерије), тропизма ткива или орган и тип преноса (фекално-орални, парентерални итд.).
Антивирусне вакцине
Антивирусне вакцине могу се састојати од убијених (инактивираних), ослабљених вируса (задржали су способност репликације, али су изгубили велики део свог патогеног потенцијала) или вирусних подјединица (вакцине нове генерације настају, на пример, од вирусних перикапсидних протеина, способан да стимулише пасивни имунитет). Припрема нове генерације је вакцина против хепатитиса Б, заснована искључиво на капсидном гликопроеину вируса ХБВ.
Остали чланци о "Структури и класификацији вируса"
- Вирус
- Умножавање вируса
- Болести изазване вирусима и антивирусним лековима