Отпорни микробни сојеви могу:
- Производе ензиме за модификацију лекова (на пример, бета-лактамазе);
- Промените структуру на коју лек делује;
- Користите другу метаболичку линију осим инхибиране;
- Промените пропустљивост ћелија, спречавајући пролаз или адхезију молекула дејством антибиотика.
ГЕНЕ Р, који преноси резистенцију на антибиотике, налази се у плазмидима, а посебно у ТРАНСПОСОНИМА (стога се транспозон може наћи у плазмиду, али и интегрисан у хромозому резистентне бактерије).
За даље информације погледајте наменски чланак: Бактерије: генетика и механизми преноса генетских информација
организма, обично сачињеног од ГРАМ -а. Такође треба запамтити да сам антибиотик не ствара резистенцију (која потиче од мутација и преноса гена), већ је бира.С друге стране, резистенција није феномен адаптације на антибиотик, већ догађај - спонтан и преносив - који утиче на генетско наслеђе бактерије.
За избор најприкладнијег антибиотика у свакој ситуацији потребно је изоловати бактерију применом одговарајућих анализа и тестова (узорковање брисевима, биопсија итд.). Бактерије се затим размножавају у одговарајућим медијима за културу; затим се различити антибиотици тестирају методом која се назива антибиограм.
Бактерије се затим шире (технички назив платирано или инокулирано) у петријеву здјелу која садржи агар медиј (чврста), унутар којег се дистрибуирају упијајући папирни дискови (звани бибула). Сваки од ових дискова натопљен је одређеним антибиотиком. Након 24 сата процењује се раст бактерија око диска: што је већи радијус инхибиције, то ће антибиотик бити ефикаснији.
Постоје две врсте антибиограма, један директан и један индиректан. Први се изводи директно на патолошком материјалу и има велики недостатак што није селективан (знамо да је одређени антибиотик био мање -више ефикасан од другог у смањењу микробне популације, али не знамо колико је активан против појединачни патоген). У индиректном, с друге стране, патолошки агенс се прво изолује из узорка и различити тестови се изводе само на њему.
Да би се зауставио феномен резистенције на антибиотике, важна је и сарадња пацијента, који мора наставити терапију до времена које одреди лекар, а да је не прекида - као што се често дешава - на прве знакове побољшања.