Постоје посебни метаболички путеви који се могу дефинисати да би се идентификовала изградња специфичних молекула.
Пут схимимске киселине: секундарни метаболички пут који има за претходник сцимимску киселину, молекул који у себи садржи оне структурне и хемијске карактеристике које се могу наћи у секундарним метаболитима који из њега потичу.
Молекул сцимимске киселине састоји се од: 6-чланог прстена, 1 карбоксилне групе и 3 хидроксилне групе.Исту исту молекуларну архитектуру можемо пронаћи у секундарним метаболитима који из ње потичу, а који се у ствари називају дериватима киселина. сцицхимиц. Сцицхимиц ацид потиче од спајања два интермедијера два различита примарна метаболичка пута:
еритрозијум-4-фосфат (3Ц): међупродукт тамне фазе фотосинтезе, анаболички метаболички процес;
фосфоенолпирувична киселина (3Ц): међупродукт гликолизе, катаболички метаболички процес;
Према томе, еритрозијум-4-фосфат + фосфоенолпирувична киселина = сцицхимиц ацид: први прекурсор секундарних метаболичких путева.
Ћелија синтетише сцимимску киселину када су потребе такве да то дозвољавају, или када су количине два примарна интермедијера толике и такве да се могу акумулирати; то се дешава када у ћелији постоји довољна количина АТП -а успорава реакције примарног катаболизма и анаболизма.
Пут малонске и мевалонске киселине: оба прекурсора потичу од молекула ацетил ЦоА, па оба леже у основи једног пута: ацетатног пута. Ацетил ЦоА је молекул везе између гликолизе и Кребсовог циклуса и стога га можемо дефинисати као посредник примарни метаболизам ћелије.
Ацетатна група (група са два атома угљеника) + ЦоА (коензим А) = Ацетил ЦоА: молекул који припада примарном метаболизму, који се користи као биолошки градивни блок у изградњи секундарних метаболита.
Ацетатни пут се затим разликује по путу малонске киселине и путу мевалонске киселине.Коензим А делује као транспорт две угљеничне јединице из цитоплазме у митохондрију ћелије, где се одвија Кребсов циклус. Угљеник се уместо тога транспортује на друго место у случају вишка енергије и могу настати најразличитији секундарни метаболити; они имају паран број атома угљеника као заједничку карактеристику, укључујући малонску киселину (Ц4) и мевалонску (Ц6).
Метаболички путеви сцимимске киселине и ацетата стога поседују прецизну молекуларну архитектуру, што нам омогућава да лако идентификујемо њихове секундарне деривате. За тхе алкалоиди, који имају разноврсну архитектуру, идентификација претходника није тако лака; другим речима, није тако лако класификовати појединачне категорије алкалоида, пратећи сваки од њих до једног претходника. Алкалоиди, у ствари, имају више од једног прекурсор, будући да потичу од аминокиселина (примарна једињења азота, која ћелија користи за производњу секундарних молекула азота). Секундарни метаболити азота су углавном алкалоиди, али постоје и други молекули са нижим здравственим профилом од њиховог, попут цијаногених гликозиди (садржани у горким бадемима) и β-цијанос (пигменти) Аминокиселине су азотна једињења међусобно разнолика и ова разноликост одражава диверзификацију њихових директних деривата, а то су алкалоиди.
Једини хемијски елемент који уједињује различите категорије алкалоида је атом азота затворен у хетероциклични прстен или барем атом азота са слободним електронским дублетом који им даје основна својства; иста основна реактивност која нам омогућава да издвојимо појединачне алкалоиде померањем.
Можемо то сажети рекавши то пут угљених хидрата је метаболички пут који је у основи синтезе свих секундарних метаболита, стога укључује све претходно виђене метаболичке путеве:
- ацетат је производ потпуног рушења молекула глукозе;
- аминокиселине потичу из метаболичких процеса разградње угљених хидрата;
- сцимиминска киселина је прекурсор секундарних метаболита, али и ароматичних аминокиселина (фенилаланин, триптофан и тирозин);
-гликозид је секундарни метаболит који се састоји од шећера плус јединице без шећера, назване агликон, који вероватно потиче од једног од сумираних метаболичких путева.
Сви биогенетски градивни блокови из којих потичу секундарни метаболити потичу или из катаболизма угљених хидрата или из њиховог анаболизма. Ови шећери су исте шећерне јединице које су некада повезане са агликоном сачињавале гликозиде.
Метаболички пут ацетата подељен је на густо биогенетско дрво које садржи сва имена секундарних метаболита до којих долази. Различито, у зависности од потреба саме ћелије:
- Кребсов циклус са коначном производњом АТП -а (примарни метаболизам);
- β-оксидација и синтеза масних киселина (примарни метаболизам);
- Синтеза малоната или малонске киселине (4Ц), настала удруживањем два молекула ацетата, и мевалоната или мевалонске киселине (6Ц), изведена спајањем три молекула ацетата. Ћелија користи ова два молекула са парним бројем атома угљеника за изградњу различитих молекуларних категорија, које се састоје од линеарних ланаца угљоводоничних јединица, као што су: масне киселине - које се користе за производњу глицерида и воскова - терпеноида, антрахинона и стероида.
Остали чланци о "Биогенези и карактеристикама активних састојака"
- Примарни метаболизам и секундарни метаболизам биљке
- Фармакогнозија
- Метаболички пут сцицхимиц ацид