Пептидна веза је ковалентна веза која се успоставља између два молекула, када карбоксилна група једне реагује са амино групом друге реакцијом кондензације (или дехидратацијом, што доводи - то јест - до уклањања молекула воде) .
Обично се пептидна веза формира између две аминокиселине, што резултира дипептидом.
Пошто дипептид у свом молекулу још увек садржи амино и карбокси групу, може формирати пептидну везу са трећом аминокиселином, стварајући трипептид итд. Када је број аминокиселина релативно мали назива се олигопептид, а ако се повећава број аминокиселина назива се полипептид или протеин.
У стварности, упркос слици, пептидна веза није једноставног типа, већ има 60% једноструку везу и 40% двоструку везу.
У живим организмима формирање пептидне везе катализује ензим - пептидил трансфераза - присутан у главној подјединици рибосома.
Протеини који се уносе у исхрану такође се састоје од ланаца аминокиселина спојених пептидним везама. Током варења ове везе се прекидају посебним ензимима (пептидазама) присутним у желудачном соку и соку панкреаса. Појединачне аминокиселине, једном апсорбоване у цревима, излазе из крви и преузимају их ћелије - посебно оне из јетре - које их уједињују путем нових пептидних веза и формирају протеине који су им потребни (не само структурни већ и хормонски, ензимски итд. У ствари, у природи постоји велики број протеина, са различитим физичко -хемијским карактеристикама, који произилазе из различитих својстава 20 обичних аминокиселина и из њиховог комбиновања у полипептидном ланцу. Само помислите да протеин од 100 аминокиселина, дакле релативно мала, може се састојати од 20100 = 1,27 к 10130 могућих полипептидних ланаца.Упутства за изградњу исправног ланца аминокиселина садржана су у геному појединца.