ПХ столице је нормално неутралан или благо алкалан (6,8 - 7,5). Киселија столица, физиолошка само код новорођенчета, може указивати на цревне инфекције (Есцхерицхиа цоли, Ротавирус) или пробавне сметње, попут интолеранције на лактозу или масти (стеатореја због инсуфицијенције панкреаса или билијарне застоја).
На пХ столице утичу прехрамбене навике испитаника; на пример, исхрана претерано богата месом и млечним производима чини столицу алкалнијом. Гнојна цревна бактеријска флора, у ствари, уништава аминокиселине које су избегле апсорпцију, стварајући токсине и амине непријатног мириса; следствено томе, пХ измета има тенденцију повећања као резултат повећане производње амонијака. Стога није случајно што је фекални пХ који је превише алкалан, праћен смањењем кратколанчаних масних киселина (види бутират), повезан са повећаним ризиком од колоректалног карцинома.
Ако пХ измета има тенденцију повећања у присуству трулежне дисбиозе, има тенденцију смањења у присуству ферментативне дисбиозе, чији узроци се налазе у прекомјерном уносу угљених хидрата или у лошој апсорпцији истих ( целијакија). Чак и у присуству „обилног уноса липида, у вегетаријанској исхрани и током дужег поста, пХ столице постаје кисео.
Да би се избегло искривљавање резултата теста, столица не сме бити контаминирана урином и мора се брзо хладити како би се спречило да амонијак и труле бактерије у урину учине фекални пХ алкалним.